Leyendo tu pregunta y alguna respuesta debo decirte que mezclas conceptos.
Cuando has estudiado lo suficiente uno se da cuenta que en tonalidad, progresión etc.
cualquier nota sirve para hacer un solo, dependiendo de cómo la uses (cromatismos, bends de semitono para ir dentro de la tonalidad...)
estará bien o mal empleada. Ahora vamos más al detalle.
Si tienes una progresión con triadas en la
Tonalidad menor de La puedes:
1 - Tocar las notas de cada acorde que esté sonando
2 - Tocar otro acorde de esa tonalidad sobre el acorde que suene (por ejemplo s suena C tu tocas el arpegio de Em)
3 - Tocar una de las
4 pentatónicas menores que tiene esa escala (yo distingo entre la penta de C mayor y A menor, aunque tengan las mismas notas no suenan igual). Si no entiendes este te recomiendo mi curso de Escalas Pentatónicas Básicas vas a aprender a improvisar con ellas y a usarlas por todo el diapasón.
4 - Tocar la escala natural entera con sus diferentes digitaciones (que erróneamente has llamado modos. Los modos no es empezar en la nota E de la tonalidad de C mayor, son algo mucho más profundo)
A partir de este punto la cosa se pone más interesante / compleja y tiene que ver con tu duda de si todas las notas funcionan bien. Aquí entra en juego la duración de los acordes, no suena igual que C y Am se toquen uno tras otro en cada pulso o que cada acorde dure por ejemplo 2 compases de 4/4:
5 - Evitar notas de la escala que estén a medio tono por encima de alguna de las del acorde que suena (si tocas sobre un C evita tocar la nota F, si tocas sobre Em evita tocar la nota C) esto es lo que se conoce como Regla b9 y hace que suene todo maravilloso.
6 - Piensa cada acorde (triadas para hacerlo más simple) mayor como un 4º grado y los menores como un 2º. Lo que ocurre es que como solista cambias de tonalidad aunque el backing track no lo haga pero lo haces en los puntos correctos con lo que todo va sonando bien.
7 - Para usar las tensiones rompiendo la Regla b9 necesitas un backing track con sonoridad modal, por ejemplo, este acorde F/E define el modo Frigio de E con lo que ahora la nota de F que antes no deberías usar la puedes usar sin problema y además enfatizándola. En cuanto a las digitaciones lo comentado en el pto 4, puedes usar cualquiera pero en el caso del ejemplo la nota E al estar en su modo Frigio es la más importante de toda la escala y ya no lo es ni C de su tonalidad mayor ni A de su tonalidad menor.
Un apunte más con lo de la nota B sobre Dm. En los libros de armonía se dice que esa nota no se debería usar ya que forma tritono con la nota F (como ves es importante controlar de intervalos) pero lo cierto es que suena muy bien. Así que si la puedes usar. Piensa que si solo se usasen las notas del acorde que suena, todo sonaría igual y muy sobrio.
La magia está en las notas que se le añaden al acorde al hacer el solo.
Lo importante es que sepas de antemano cómo suena cada intervalo con respecto a la tónica del acorde o directamente sobre ese acorde. Te dejo un video en el que explico un ejercicio muy bueno para entrenar el oído: