Solución elegida por el creador del hilo (Andreu)
Eso es algo común cuando se mezclan pastillas. No tienes más que cambiar el cable que va a masa y el que va al selector de una (solo una) de las pastillas.
Posiblemente cada uno de las pastillas tenga los imanes con una polaridad en cada dirección distinta, no hay un standard entre marcas, puedes comprobarlo con un iman o con otra pastilla acercandola, deberia solucionarse al invertir uno de los imanes de las pastillas.
Puedes tener una de las pastillas dada la vuelta.
De todas formas, si están fuera de fase elige una y conéctala al revés. Imagino que ahora llevarás el cable negro a tierra y ek blanco al switch en las dos. Pues una de ellas cableala al reves: negro al switch y blanco a tierra.
No se si en alguna de las pastillas tienes dos cables y la malla. Si es así invierte los dos cables. La malla siempre a tierra.
A mi también me ha pasado alguna vez. Las gretsch y las tv jones suelen tener la fase al revés, deberás conectar una de las dos pastillas de manera inversa y solucionado.
Eso es algo común cuando se mezclan pastillas. No tienes más que cambiar el cable que va a masa y el que va al selector de una (solo una) de las pastillas.