Como le hacen para tocar en otras afinaciones?

Es decir, como se saben donde van los acordes y como son ahora, que forman tienen?
Como se cambia toda la estructura mental de lo que se sabe en la afinación standar, a por ejemplo, C#? o C? (para hacerlo mas fácil)

Lo más simple es no pensar en la nueva tonalidad. Y hacer un descenso de la la afinación toda la agrupación al unísono.

Yo toco en D, pero si necesito una pieza en E, sencillamente coloco un capotraste en el traste 2.

Y si necesitas analizar la altura real de las notas te basas en una tabla como esta:
E (sexta cuerda al aire)=D
F=E
G=F
A=G
B=A
C=B
D=C
Siempre teniendo en cuenta los accidentes de la escala para asignar los correspondientes sostenidos y bemoles

Para afinaciones que se basan en la misma distancia tonal que la afinación estándar no hay problema, la forma de los acordes y las escalas se conservan exactamente igual pero transladadas de sitio, en función de la afinación.

Si surge un problema mayor cuando se rompe esa distancia tonal que hay entre las cuerdas como por ej. en afinaciones abiertas o drops. Si sabes cómo formar acordes y cómo llevarlos al mástil, no hay problema, solo se trata de una reestructuración y adaptación a esas nuevas formas.