Fender stratocaster american special con humbucker

Hola, hace poco me compre una fender stratocaster american special con humbucker, lo que pasa de raro, es que quando la afino, con la cuerda al aire est bien, pero luego quando toco la misma cuerda pero en el traste numero 12 ( que seria la misma) me sale en alguna cuerda ( la 5ta y la 3ra), desafinada, algo mas agudo de lo que deveria ser. Es esto normal? Es por las cuerdas? uso unas de 0.9. En caso de que este mal, que puedo hacer.
Gracias

Por eso mismo hay que hacer el quintaje de la guitarra. Afinas la cuerda al aire y si en el traste 12 no suena la misma nota hay que mover el tornillo de la silleta del puente con un destornillador para que avance o retroceda la cuerda, hasta que quede perfectamente afinada. Eso se llama el quintaje de la guitarra. Mira en youtube algún vídeo de quintar la guitarra.