¿En las quintas o octavas hay notas mayores o menores?

Si, o dos, o tres octavas mas altas.

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Ok todo claro, pero con respecto a las escalas si por ejemplo una escala de varias notas y me dice que en una parte toque el el traste 12 de la 6ta cuerda, vendria a ser lo mismo si toco el traste 7 de la 5ta cuerda, seria la misma escala?

Si.
Una pregunta que te hago ahora, Como afinas la guitarra? sabes afinar sin afinador? sabes comprobar la afinación de la guitarra sin afinador?

Si con eso de que en la siguiente cuerda suena igual pero en otro traste por ejemplo que el traste 5 de la 6ta cuerda suena igual a la 5ta cuerda al aire y así sucesivamente

Exactamente, pues eso es lo mismo que me preguntaste si tocas la nota en el traste 12 de la 6ta. cuerda o en el 7 de la 5ta., y si, sigue siendo la misma escala ya que el sonido de esas dos notas es igual, aunque cambies el patrón de la escala.