Aclarar que estos puentes SI tienen una posición, los ABR-1 van con los tornillos por delante y los tipo Nashville con los tornillos mirando hacia el cordal... aunque si, dependiendo de calibres se puede jugar cambiando el sentido de las silletas para cambiar el ángulo de ataque de la cuerda sobre estas.
Una cosa que suele dar bastante guerra en esta clase de puentes (una de las razones por la cual en todas mis Epiphone o asiáticas he cambiado estos puentes) es el alambre que tiene para retener los tornillos que sujetan las silletas. Este alambre (wire) tiende a deformarse con el tiempo y a abombarse hacia las cuerdas, si usas un calibre grueso, que creo recordar que has dicho que usas un 11/54 es muy probable que al tocar las cuerdas y más al hacer palm-mute es que la cuerda choque contra el susodicho alambre y te produzca ese extraño zumbido... por lo que he escuchado en el audio que has puesto es lo que me parece más probable.
Si tienes bien ajustada la curvatura del mástil, si la cejuela (el hueso) está bien y la relación entre la altura del puente y el cordal está bien y si las cuerdas apoyan perfectamente en las surcos de las silletas entonces el problema es el puente en sí, el puente de las Epiphone es una p**a mierda, simple y llanamente.
Consejo, prueba a quitarlo, con un alicate pequeño y con cuidado, sácalo y prueba... si ves que el problema se ha corregido el siguiente paso que te recomiendo es que inviertas en cambiar el puente, personalmente te recomiendo un Faber ABRM'59 (que no tiene el dichoso alambre) y meterle los postes E-Sert, que a diferencia de los "bushings" y los espárragos que traen las Epiphone de serie, llegan hasta el fondo de la madera y encajan como una sola pieza en lugar de dos, con lo que ganas en sustain y eliminas posibles vibraciones.
Prueba lo del alambre y nos cuentas.