No te preocupes por eso, es normal. Cuando empecé me costaba MUCHÍSIMO poner un fa mayor con cejilla y dos años después me manejo con acordes con sus inversiones por todo el mástil sin problema.
Esto no tiene más secreto, poner los acordes cuesta hasta que los has puesto 800 veces. Entonces sale solo. Lo bueno es que la técnica de acordes se aprende sobre la marcha, conforme los vas conociendo y comprendiendo teóricamente. Mi consejo es que para amenizarlo pues vayas tocando canciones fáciles en las que aparezcan los acordes que estás aprendiendo. Por ejemplo, para los acordes re, la y sol puedes tocar Highway to hell de ACDC. Canciones de Barricada, Nirvana, Porretas... suelen ser útiles al principio para meternos los acordes mayores. También puedes tocar Do Re Mi Fa Sol LA Si con acordes mayores.
También te aconsejo que si estás empezando vayas haciendo descansos y los aproveches para empezar a estudiar la teoría de intervalos y memorizando las notas en el mastil. Es muy sencillo de comprender y así luego podrás trasponer los acordes fácilmente por todo el mástil, pero siempre con mucha paciencia

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También me parece imprescindible calentar antes de tocar. Los típicos ejercicios de 1234 al ritmo de un metrónomo te servirán para calentar (evitarás futuras lesiones), coger ritmo y ganar agilidad, lo que después te facilitará desde tocar los acordes a las escalas. Empieza despacio y poco a poco sube la velocidad.
Espero haberte podido ayudar.