Hola, la pregunta es muy interesante, espero responderla con seriedad. Que conste que no soy profesor de acústica...
Primero de todo hay que entender de donde vienen los sonidos que suenan bien, es decir, por qué un Do, un re etc...
Mírate primero esto:
http://es.wikipedia.org/wiki/Serie_arm%C3%B3nica_(m%C3%BAsica)
Entonces, lo primero que hay que entender, es por qué un Do, y luego un sol,
Al tener Do Sol, (5a), ya tenemos un DO y un Sol, ahora a por el FA
El Fa sucede de considerar a Do como quinta, etc.
Si consideramos 5as una detrás de otra, nos surge la escala cromática.
Pero tu pregunta es por qué de Mi-FA Si-DO
en la escala físicoarmónica como puedes ver hay una 3a mayor,
El MI-FA
El Mi surge como tercera de DO, y el FA como fundamental de DO como 5a
El SI-DO...
EL SI como 3a Mayor de Sol y el Do como octava de DO
Es un tema apasionante, realmente si te adentras en el mundo microtonal todavia es más estimulante
Cuando tocas un piano o un instrumento que tiene todas las cuerdas dispuestas al aire (arpa, etc..) cuando tocas un sol, se pone en marcha el sol, el re, y el si, y todas las notas de su escala físico armónica por una cuestión de simpatía fisicoarmónica..
Es por ello que nunca afinarás bien tu guitarra con afinador electropatoso, porque no oye esas frecuencias, tu oído si las oye y tu cerebro también.
Ahora lo que sucede es que los que afinamos de oído ya afinamos mal porque los que afinan con afinador ya han acostumbrado su oído a la afinación sin armónicos, y ahora resulta que afinar de oído no resulta como el afinador. Tristemente parece que el afinador tiene la última palabra. ......
Resumiendo, las notas mi y si, son terceras de Do y sol respectivamente... Lo que todavía no está claro de donde sale la 3a menor, no sale en la escala fisico armónica, ¿escala fisicoarmónica invertida?
Saludos...