Ayuda con el quintaje de las cuerdas

Al volver a coger la guitarra tras partirme la clavícula jugando al fútbol pues estaba más desafinada que mi abuela y la afiné. Sorpresa que me llevé que estaba desquintada, me informé y empecé a quintarla desde la sexta a la primera. Mayor sorpresa me llevé cuando no pude (ni puedo ) quintar la primera cuerda, las otras no me dieron ningún problema. Al pulsar en el traste 12 me da un mi muy bajo bastante desafinado y al aflojar el tornillo del puente veo que le falta recorrido. Se sale el tornillo antes de poder quintarla medio decente; a parte de que si siguiese acortando la cuerda chocaría con el tornillo que sujeta el puente al cuerpo (digo yo ¿no?).
¿Cómo podría solucionarlo?
Gracias de antemano.

Quizás la cuerda esté destemplada por el tiempo, cambia las cuerdas

Muchas gracias por tu respuesta Bitelino, pero aún me queda una dudilla más. ¿Al poner la cuerda debo ponerla conforme he dejado el cacharrillo que alarga y acorta las cuerdas? Es decir, al límite, impidiendo que se pueda acortar en el supuesto caso que lo necesitara. ¿O debo primero poner la cosa esa en una posición intermedia para tener margen para acortarla o alargarla al quintarla en el hipotético caso? ¿O simplemente es una paranoia mía sin sentido?