Te respondo por orden:
1) Sí, funciona como tarjeta de sonido externa.
2)No sé si mejorará el sonido al conectarlo directo al PC, pero pasa una curiosidad y es que cuando escuchas la guitarra antes de grabar suena distinto a después de haber sido grabada (hay algunos temas en los foros de Line6 al respecto). Y por supuesto que la latencia baja, no tanto como uno esperaría hasta de las tarjetas más económicas, pero baja lo suficiente como para grabar tranquilamente.
3) Para grabar lo que salga del POD tienes que tener un programa host (Cubase, Adobe Audition, Logic, Acid, ProTools, etc) y luego aplicarle a la pista de audio ya grabada el proceso que tú desees, incluyendo el Amplitube.
Ahora, si quieres una interfaz sólo para pasar la guitarra al PC y ocupar siempre el Amplitube, creo que es un desperdicio de plata comprar un POD, ya que a grandes rasgos, la ventaja del X3 sobre el UX2 son la cantidad de simulaciones.
Espero te sirva... saludos.