Que deberia hacer

Hola, mi duda es, tengo un fender frontman 65r con su footswitch y una pedalera zoom g1x

y quisiera saber si tendria que usar la distor del ampli y mandar la pedalera por el loop de efectos y sacar las modulaciones y demas efectos de ahi, y en caso de ser asi, como podria hacer por ej: si quiero pasar de canal limpio+chorus al canal de distorsion+booster.

Tu idea de la conexión al loop es correcta.

Pero tu intencion de cambiar simultaneamente patchs de tu multiefecto y de canales de tu ampli no es posible ya que tu multiefecto no puede controlar cambios de canal.