Hola de nuevo!

Vamos por partes:
- En Cubase se pueden instalar todos los plugins que quieras, luego estos los puedes utilizar como inserciones, sends, etc,... Para ello fijate que la librería .dll de lo que instales se quede en el directorio ...Steinberg\Cubase SX 3\Vstplugins (si no puede que no te aparezca en las inserciones de cubase)

- El mezclador de Cubase (tecla F3 y a la derecha del todo) no se debería tocar, es decir, debería estar siempre a 0 dB. Lo que si se debe tocar son los volúmenes de cada pista. En esta pista de master es donde puedes aplicar el LM2 como efecto de inserción y así ampliar la potencia de cada pista. El LM2 te permite mantenerte en 0 ó en -1 dB (o el margen que tu quieras) dando mucha más presencia a todas las pistas. Si utilizas esto, presciende del Multiband.

- En cuanto a la batería, yo la exportaría directamente del Guitar Pro en formato midi y luego con el Cubase la importaría como Midi. Una vez hecho esto, cargas un VST de baterías (Ez Drumer, Addictive Drums, Battery, DFH,... el que sea) y asignas esa pista midi al VST previamente cargado.
Con el bajo haría lo mismo.

Espero haberte ayudado.
Un saludo!!!