Buenas Edgar! Hay un par de cosas que puedes probar.
Primero de todo te diría que la manera mas fácil de tocar mas grave es bajando únicamente la 6ta cuerda un tono (Drop D se llama esta afinación). Si esto no te convence y quieres seguir con afinación en RE seguramente tendrás que usar cuerdas un poco mas grandes. Las hay específicas para afinaciónes bajadas, pero por lo general tienes que a 11-52 o 11-56 para bajar a RE.
Un vez en RE puedes probar tambien lo primero (bajar todfa la afinación a RE y luego bajar la 6ta a DO, así estás tocando solo un semitono por encima de barítono).
La escala en principio no ha de ser problema, pero hasta que no pruebes a bajar no lo sabrás. Yo he tocado mucho tiempo en varios dropped con una Les Paul Studio y 0 problemas con minimos ajustes y cuerdas gansas, pero luego he tenido problemas con una PRS de gama alta porque la 6ta siempre sonaba como un fideo.
Suerte con las nuevas afinaciones!
Compañero edgar, sinceramente, estás haciendo las cosas siempre a medias... como la otra vez con el calibre y la octavación. Si quieres bajar calibre tienes que ajustar la guitarra en consecuencia, eso es así y no tiene atajo... ajustar más o menos dependerá de lo que la guitarra necesite, pero no de lo que tú quieras... si quieres tocar en D y no quieres tener trasteos, tienes que ajustar la guitarra... si no sabes hacerlo, tendrás que llevarla a que lo hagan, no tiene más historia...
Por tanto, a tus preguntas... dices que si es necesario? pues si te está trasteando es necesario ajustar, alma o puente, dependerá, pero necesario es...
Consejo para afinar la guitarra? Para eso no hay consejo, dar vueltas al clavijero... pero afinando de una u otra forma no vas a conseguir que la guitarra se ajuste sola.
Posible afinar una guitarra de 25.5 en do o si? totálmente posible y totálmente común, con un calibre adecuado y ajustando la guitarra, obviamente
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Mira la verdad es como dicen arriba la guitarra y su ajuste no tiene mucha historia pero tenes que saber hacerlo y si como dicen arriba ya tuviste un problema de no saber ocatavar bien o tuviste dudas con eso lo ideal es que te lo haga alguien que sepa y te muestre con una guitarra en mano como hacerlo. Por lo menos yo aprendi de esa manera y nunca tuve problemas